More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2136 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  52.63 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  49.17 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  49.51 
 
 		 335 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  46 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  42.19 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  35.53 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  44.08 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  40.4 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  36.81 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  33.56 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  33 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  33.66 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  33.66 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.32 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  32.68 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  32.25 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  31.92 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.92 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.92 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  37.13 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  36.76 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  34.65 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.23 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  32.99 
 
 		 329 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3219  protein of unknown function DUF58  36.3 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000742031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  30.37 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  30.88 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  29.72 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.57 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  30.55 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  32.65 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.15 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  38.36 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  26.75 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.71 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.66 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  35.19 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.81 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  36.2 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  32.81 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.77 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.06 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  29.55 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  31.15 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  34.55 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.72 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.71 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  31.72 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.98 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.21 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.17 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  30.47 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  35.56 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.57 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.34 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.35 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.02 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  34.48 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  30.23 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.6 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27.19 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  30.5 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.97 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.93 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  25.41 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23.63 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.32 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.03 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.91 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30.58 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.29 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  33.17 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.29 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  45.54 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  37.59 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  29.18 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  37.59 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  42.55 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>