77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1992 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 365 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  97.53 
 
 		 365 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  93.7 
 
 		 365 aa  714    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  83.29 
 
 		 366 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  83.98 
 
 		 366 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  83.29 
 
 		 366 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  83.89 
 
 		 366 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  83.61 
 
 		 366 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  83.33 
 
 		 366 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  83.61 
 
 		 366 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  83.89 
 
 		 366 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  54.65 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  53.67 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  53.67 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  53.82 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  55.96 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  55.06 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.53 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.43 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  52.54 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  53.26 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.28 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  53.26 
 
 		 389 aa  348  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  47.67 
 
 		 379 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  48.62 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  50.56 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  51.59 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  47.08 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  47.08 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  48.18 
 
 		 376 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.97 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  38.48 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  38.48 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.56 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.18 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  27.98 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.53 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.62 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  23.49 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  34.86 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24.87 
 
 		 444 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  35.59 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  33.9 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  33.9 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  33.9 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.79 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  33.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  33.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  33.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  33.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.1 
 
 		 748 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.67 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  33.59 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  32.2 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  36.99 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  36.99 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  24.58 
 
 		 934 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2697  hypothetical protein  26.58 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208385  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  25.42 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  23.65 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  23.98 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  31.36 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>