More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1888 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  61.64 
 
 
165 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  49.67 
 
 
200 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  51.37 
 
 
152 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  52.05 
 
 
200 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  52.05 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  52.05 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  52.05 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  52.05 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  52.05 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  50 
 
 
153 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  47.95 
 
 
156 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  52.05 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 
156 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  48.63 
 
 
157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  47.74 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  47.1 
 
 
159 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 
159 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  47.26 
 
 
159 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 
159 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  41.22 
 
 
151 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  41.22 
 
 
151 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  49.32 
 
 
164 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  46.31 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  45.89 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  42.07 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  45.21 
 
 
157 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 
157 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  38.67 
 
 
156 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  43.12 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  42.76 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  46.58 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 
163 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
169 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  39.31 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.38 
 
 
155 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  43.45 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
150 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  38.71 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.42 
 
 
157 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  41.78 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  41.38 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 
318 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  39.19 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.82 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  41.61 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.82 
 
 
155 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.24 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
158 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.95 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  39.74 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  39.19 
 
 
152 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  37.34 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
145 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34 
 
 
145 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  39.74 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
156 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.93 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  39.47 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  35.1 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.11 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  39.86 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  39.86 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  39.86 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
148 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.58 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.77 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  37.58 
 
 
317 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.46 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.85 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38 
 
 
154 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>