More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1744 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  65.81 
 
 		 274 aa  354  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  61.25 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  59.11 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 282 aa  161  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.17 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.87 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 287 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  38.8 
 
 		 847 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  36.12 
 
 		 847 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08463  conserved hypothetical protein  40.19 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  39.55 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>