More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1630 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  751  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  85.82 
 
 
416 aa  683  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  90.87 
 
 
417 aa  739  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0976  aspartate kinase  81.45 
 
 
416 aa  658  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  91.59 
 
 
417 aa  742  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  85.1 
 
 
416 aa  687  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  7.63531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  91.83 
 
 
416 aa  747  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  79.43 
 
 
453 aa  642  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  91.11 
 
 
417 aa  739  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  83.37 
 
 
416 aa  677  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  91.83 
 
 
416 aa  742  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  85.82 
 
 
416 aa  694  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  2.3583e-09  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  91.11 
 
 
417 aa  739  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  100 
 
 
416 aa  840  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  7.35102e-05  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  85.82 
 
 
416 aa  685  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  98.56 
 
 
416 aa  830  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  92.31 
 
 
416 aa  750  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  90.87 
 
 
417 aa  733  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  91.11 
 
 
417 aa  739  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  94.95 
 
 
416 aa  764  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  85.82 
 
 
416 aa  683  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  76.07 
 
 
422 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  76.07 
 
 
422 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  75 
 
 
422 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  75.89 
 
 
422 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  75.18 
 
 
422 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  74.94 
 
 
423 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  74.94 
 
 
422 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  75.18 
 
 
422 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  74.22 
 
 
421 aa  613  1e-174  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  73.75 
 
 
422 aa  608  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  71.08 
 
 
408 aa  582  1e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  68.75 
 
 
409 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  70.36 
 
 
409 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  68.43 
 
 
406 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  62.92 
 
 
428 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.57046e-13  hitchhiker  3.74387e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  64.73 
 
 
410 aa  540  1e-152  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  62.92 
 
 
428 aa  540  1e-152  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.45942e-05  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  64.73 
 
 
410 aa  540  1e-152  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  66.35 
 
 
412 aa  538  1e-152  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  64.49 
 
 
411 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  64.25 
 
 
411 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  64.34 
 
 
412 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  64.66 
 
 
413 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  9.67452e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  64.1 
 
 
412 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  63.04 
 
 
411 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  63.04 
 
 
411 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  64.58 
 
 
413 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  9.37685e-05  decreased coverage  1.09716e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  63.04 
 
 
411 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  66.27 
 
 
409 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  63.61 
 
 
424 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  64.35 
 
 
408 aa  521  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.53157e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  63.46 
 
 
413 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  66.18 
 
 
410 aa  517  1e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  65.54 
 
 
409 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  63.01 
 
 
427 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.35622e-10  hitchhiker  1.29841e-08 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  60.34 
 
 
408 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.8313e-10  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  64.99 
 
 
410 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  64.01 
 
 
416 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  62.89 
 
 
414 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  64.42 
 
 
408 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  60.77 
 
 
405 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  64.42 
 
 
408 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  61.02 
 
 
405 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.66682e-14  hitchhiker  8.23679e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  60.29 
 
 
407 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.67569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  60.05 
 
 
405 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  62.47 
 
 
410 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  1.24538e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  59.52 
 
 
404 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.23474e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  62.32 
 
 
416 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  61.15 
 
 
414 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  1.47671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  58.84 
 
 
404 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.1173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  59.52 
 
 
410 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.23126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  58.35 
 
 
404 aa  466  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.47386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  58.65 
 
 
418 aa  460  1e-128  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  59.23 
 
 
406 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  58.64 
 
 
411 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  55.06 
 
 
423 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  57.28 
 
 
419 aa  445  1e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  56.66 
 
 
417 aa  441  1e-122  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  55.77 
 
 
405 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  53.73 
 
 
409 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  54.59 
 
 
424 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  54.78 
 
 
417 aa  429  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  55.16 
 
 
406 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  54.42 
 
 
419 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  54.59 
 
 
423 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  52.3 
 
 
408 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  53.11 
 
 
412 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  54.35 
 
 
423 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  55.98 
 
 
411 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  53.83 
 
 
418 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  54.12 
 
 
424 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  52.29 
 
 
409 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  55.5 
 
 
411 aa  417  1e-115  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  51.43 
 
 
412 aa  416  1e-115  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>