188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1530 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  100 
 
 
232 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  93.1 
 
 
232 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  77.19 
 
 
230 aa  361  5e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  75.65 
 
 
230 aa  360  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  75.88 
 
 
230 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  74.12 
 
 
230 aa  352  3e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  74.12 
 
 
230 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  74.12 
 
 
230 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  73.25 
 
 
230 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  68.18 
 
 
242 aa  317  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  67.39 
 
 
230 aa  315  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  63.88 
 
 
233 aa  294  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  58.95 
 
 
239 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  57.21 
 
 
230 aa  284  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  59.55 
 
 
230 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  60 
 
 
239 aa  273  1e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  53.71 
 
 
231 aa  271  8e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  56.03 
 
 
243 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  52.4 
 
 
231 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  1.48082e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  51.09 
 
 
231 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  52.4 
 
 
230 aa  268  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  51.09 
 
 
230 aa  268  6e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.93401e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  53.28 
 
 
229 aa  268  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  51.09 
 
 
231 aa  267  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  8.27408e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  52.84 
 
 
230 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  56.33 
 
 
230 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  51.97 
 
 
232 aa  266  3e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  51.97 
 
 
235 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  51.97 
 
 
235 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  51.97 
 
 
232 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  51.97 
 
 
232 aa  265  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  51.75 
 
 
234 aa  264  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  51.09 
 
 
231 aa  264  9e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  51.09 
 
 
232 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  3.97336e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  55.02 
 
 
230 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  51.53 
 
 
232 aa  261  5e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  51.09 
 
 
231 aa  261  5e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  51.97 
 
 
230 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  54.59 
 
 
230 aa  259  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  54.59 
 
 
230 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  56.14 
 
 
238 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  51.53 
 
 
231 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  50.44 
 
 
236 aa  254  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  6.32506e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  52.23 
 
 
225 aa  253  1e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  50.66 
 
 
233 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  50.22 
 
 
230 aa  252  4e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  52.84 
 
 
229 aa  251  9e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  52.4 
 
 
246 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  49.56 
 
 
235 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  50.22 
 
 
239 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  49.34 
 
 
233 aa  243  2e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3231  putative racemase  53.71 
 
 
235 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.34766e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  48.47 
 
 
232 aa  242  4e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3165  putative racemase  53.71 
 
 
235 aa  242  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  48.47 
 
 
231 aa  242  4e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3246  putative racemase  53.71 
 
 
235 aa  242  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.45722e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3183  putative racemase  53.71 
 
 
235 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3347  putative racemase  53.71 
 
 
235 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.042763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4072  aspartate racemase  54.94 
 
 
233 aa  239  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  0.78132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  50.43 
 
 
241 aa  239  3e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  51.3 
 
 
230 aa  238  7e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  48.91 
 
 
230 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  52.27 
 
 
230 aa  233  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  50.43 
 
 
239 aa  231  7e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0005  aspartate racemase  47.84 
 
 
232 aa  231  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  45.69 
 
 
233 aa  228  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  47.16 
 
 
237 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  45.58 
 
 
231 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.29712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  47.84 
 
 
239 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  48.26 
 
 
239 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  41.3 
 
 
229 aa  223  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  46.52 
 
 
239 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2031  aspartate racemase  44.64 
 
 
240 aa  215  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0604958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2787  aspartate racemase  48.47 
 
 
237 aa  213  2e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6429  aspartate racemase  42.74 
 
 
234 aa  212  4e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.390115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0185  hypothetical protein  51.09 
 
 
238 aa  211  6e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  44.1 
 
 
230 aa  209  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  46.72 
 
 
229 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  38.86 
 
 
231 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  39.3 
 
 
231 aa  207  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  38.86 
 
 
231 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  44.98 
 
 
229 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  39.04 
 
 
226 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  2.01094e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  45.69 
 
 
305 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  37.72 
 
 
226 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  37.72 
 
 
227 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  37.72 
 
 
226 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  37.72 
 
 
226 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  37.72 
 
 
226 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  37.72 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  37.72 
 
 
226 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  37.72 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  37.28 
 
 
226 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  37.28 
 
 
226 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54701e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>