148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1508 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  86.96 
 
 		 162 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  69.81 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  53.75 
 
 		 157 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  53.75 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  53.33 
 
 		 152 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  53.33 
 
 		 151 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  56.25 
 
 		 150 aa  161  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  55.63 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  57.55 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  55.15 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  52.14 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  52.9 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  52.21 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  51.77 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  43.57 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  47.5 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.5 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.5 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.4 
 
 		 196 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.71 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  40.6 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  37.59 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  36 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.03 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  47.5 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  31.54 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  31.03 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.54 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.42 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.15 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.47 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.74 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.35 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  30.88 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  29.29 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.45 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  57.14 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.78 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.88 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  32.69 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  29.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  31.69 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  27.94 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.15 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  30.41 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  34 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.87 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  34.31 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  35.97 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  35.97 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  35.97 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  30.97 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  29.17 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  31.85 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  36.67 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.54 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.09 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.67 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  30.41 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  34.04 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  25.97 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  29.41 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.82 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  29.93 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.82 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.37 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  30.38 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.76 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  32.39 
 
 		 636 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.11 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  24.82 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  26.62 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.25 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.62 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.85 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.92 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>