More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1411 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 327 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  88.38 
 
 		 327 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  77.19 
 
 		 328 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  67.31 
 
 		 332 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  64.76 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  62.66 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  57.76 
 
 		 331 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  57.81 
 
 		 331 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  59.28 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  55.06 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  52.17 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  52.05 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  54.63 
 
 		 334 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  43.53 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  42.21 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  37.7 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.76 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  34.27 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  35.87 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  33.64 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  36.31 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  36.08 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.7 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  36.22 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  30.98 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  32.21 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  29.75 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  29.75 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  29.45 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.82 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  34.08 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  32.93 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  28.03 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  27.49 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  26.77 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  31.08 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.57 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  27.84 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  28.92 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  26.23 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  29.82 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  26.74 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  26.94 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  24.66 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  26.07 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.1 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.39 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  31.22 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  31.97 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  31.22 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  27.36 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  27.42 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  30.04 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.67 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  27.5 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  30.67 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.56 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  26.15 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  23.23 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.31 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  29.86 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  32.42 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  29.17 
 
 		 442 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  26.86 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  29.58 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  23.53 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  29.58 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  28.83 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  29.63 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  31.02 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  26.82 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  24.26 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  29.74 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  24.25 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0724  selenophosphate synthetase  26.94 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1773  AIR synthase-like protein  25.6 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  29.77 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.73 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0130  AIR synthase-like protein  25.12 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.633994  normal  0.0459155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  30.26 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  25.88 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  31.71 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  28.17 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  26.32 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>