More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1382 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1382  polar amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282532  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.96 
 
 
258 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.14 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.38 
 
 
263 aa  265  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  51.63 
 
 
254 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  54.32 
 
 
254 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.59 
 
 
268 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  51.97 
 
 
267 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.11 
 
 
256 aa  261  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  51.57 
 
 
255 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.91 
 
 
274 aa  261  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  53.5 
 
 
254 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.56 
 
 
254 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.28 
 
 
261 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
244 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51.16 
 
 
260 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 
254 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  258  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  53.5 
 
 
260 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.26 
 
 
259 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  51.02 
 
 
256 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.41 
 
 
244 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  49.6 
 
 
253 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 
244 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  51.41 
 
 
263 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  51.84 
 
 
242 aa  255  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.41 
 
 
592 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.01 
 
 
244 aa  255  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  51.59 
 
 
254 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
244 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  52.38 
 
 
256 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 
254 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
244 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.67 
 
 
250 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1456  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
261 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  52.26 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  50.81 
 
 
242 aa  251  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.21 
 
 
250 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 
257 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  49.41 
 
 
254 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  49.23 
 
 
263 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
262 aa  251  8.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  52.67 
 
 
252 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
262 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  48.65 
 
 
257 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  53.53 
 
 
248 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
240 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  52.05 
 
 
263 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.81 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.81 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.81 
 
 
250 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1292  ABC transporter related  50.78 
 
 
268 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.129998  normal  0.577563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  53.36 
 
 
261 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  48.83 
 
 
254 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  50.81 
 
 
250 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.81 
 
 
250 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.26 
 
 
240 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  52.49 
 
 
257 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  49.6 
 
 
240 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  52.44 
 
 
260 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
240 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.81 
 
 
250 aa  248  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  49.03 
 
 
279 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
244 aa  248  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  47.97 
 
 
289 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  51.95 
 
 
250 aa  248  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.99 
 
 
240 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50.81 
 
 
244 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  50.62 
 
 
254 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  53.72 
 
 
619 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.87 
 
 
595 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
247 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  50.41 
 
 
264 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  50.21 
 
 
255 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  51.97 
 
 
261 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.61 
 
 
252 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
240 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  50 
 
 
299 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  52.03 
 
 
260 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  47.86 
 
 
257 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  54.36 
 
 
253 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.4 
 
 
300 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  52 
 
 
262 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.87 
 
 
248 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.2 
 
 
250 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  49.01 
 
 
255 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  50.79 
 
 
255 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  50.6 
 
 
242 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
240 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
244 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>