More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1305 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 149 aa  303  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  93.96 
 
 		 149 aa  289  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  83.22 
 
 		 152 aa  259  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  74.32 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  74.32 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  72.97 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  72.3 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  73.47 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  73.47 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  73.47 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  72.6 
 
 		 158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  69.86 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  69.86 
 
 		 167 aa  213  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  69.86 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  67.81 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  67.81 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  67.81 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  65.07 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  54.42 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 153 aa  157  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  56.74 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  34.38 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  34.38 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.75 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  40.58 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 		 255 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  32.63 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32.63 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.38 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.03 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 324 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  29.13 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  34.38 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.28 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  37.88 
 
 		 399 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  33.03 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  43.1 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.38 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  46.67 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  40.26 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  30.47 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.33 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30.71 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  30.71 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 302 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  32.98 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 398 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  30.93 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.13 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  35.35 
 
 		 430 aa  46.2  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>