164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1300 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  89.68 
 
 
127 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  77.31 
 
 
135 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  72.95 
 
 
135 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  72.95 
 
 
135 aa  192  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  71.77 
 
 
135 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  72.95 
 
 
132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  69.42 
 
 
125 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  69.42 
 
 
125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  68.03 
 
 
124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  68.85 
 
 
132 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  67.2 
 
 
125 aa  177  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  75.63 
 
 
135 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  75.63 
 
 
135 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  75.63 
 
 
135 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  66.95 
 
 
241 aa  169  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  66.1 
 
 
241 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  66.1 
 
 
225 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  60.98 
 
 
213 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  62.1 
 
 
125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  59.29 
 
 
120 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  59.29 
 
 
120 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  57.52 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  54.17 
 
 
120 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  57.98 
 
 
126 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  57.52 
 
 
120 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  52.14 
 
 
121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  60.19 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  49.57 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  60.19 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  56.48 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  54.87 
 
 
124 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  49.58 
 
 
124 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  50.83 
 
 
126 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  53.66 
 
 
129 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  47.01 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  45.3 
 
 
118 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  47.5 
 
 
122 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  44.44 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  44.83 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  45.61 
 
 
185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  43.64 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  51.72 
 
 
120 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  43.64 
 
 
130 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  46.53 
 
 
113 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  43.64 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  42.59 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  37.5 
 
 
274 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  40.54 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  42.59 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  42.99 
 
 
113 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  37.27 
 
 
270 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  35.2 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  38.39 
 
 
175 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  36.28 
 
 
265 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  40.54 
 
 
119 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  38.1 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  37.38 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  39.05 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  36.45 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  36.27 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  41.41 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  34.26 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  31.06 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  35.78 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  36.11 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1015  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0607  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2441  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0855  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.545031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0055  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  32.71 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  38.38 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  35.51 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  36 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  31.53 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  31.53 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  31.53 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  35.83 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  31.53 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  31.43 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  34.17 
 
 
264 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3249  hypothetical protein  33.03 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  37.11 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  30.56 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  28.83 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>