236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1053 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  94.06 
 
 
220 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  79.91 
 
 
220 aa  361  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  78.54 
 
 
220 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  78.54 
 
 
220 aa  351  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  78.54 
 
 
220 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  78.54 
 
 
220 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  79.45 
 
 
220 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  77.63 
 
 
220 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  78.54 
 
 
220 aa  333  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  72.69 
 
 
220 aa  308  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  72.48 
 
 
254 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  72.48 
 
 
220 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  66.22 
 
 
239 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  66.22 
 
 
239 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  63.72 
 
 
228 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  64.89 
 
 
243 aa  279  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  63.72 
 
 
228 aa  274  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  53.77 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.27 
 
 
224 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  42.01 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  38.7 
 
 
225 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.87 
 
 
226 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  35.84 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  36.78 
 
 
241 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  41.28 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  41.28 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  41.28 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  38.07 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  40.8 
 
 
254 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  36.65 
 
 
216 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  40.7 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  37.67 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  36.07 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  31.28 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  46.94 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  43.48 
 
 
221 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  34.1 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  42.06 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  32.22 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  40.37 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  43.24 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  36.73 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  43 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  41.07 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  41 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  31.63 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  42 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  36.2 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  27.44 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  42 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  44.79 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  37.23 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.95 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  39.8 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  26.87 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  32.57 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  37.37 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  37.37 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  37.1 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  35.92 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.51 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  39.5 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  37.86 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  36.67 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  27.98 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  35.83 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  32.89 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.36 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  36.44 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  24.15 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  35.58 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  39.18 
 
 
316 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  35.64 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  35.4 
 
 
183 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  36.08 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  38.38 
 
 
194 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  32.99 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  36.84 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 
400 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  39.8 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  39.8 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  39.8 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  39.71 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  30.7 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  39.71 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>