31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1047 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  92.52 
 
 
107 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  87.85 
 
 
107 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  81.13 
 
 
112 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  82.08 
 
 
112 aa  170  7e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  80.19 
 
 
112 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  81.13 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 
112 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 
112 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.16861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 
112 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  70.75 
 
 
113 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  45.83 
 
 
109 aa  77.4  6e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  49.49 
 
 
109 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
107 aa  58.2  4e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
107 aa  57.4  7e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  52.4  2e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 
111 aa  52.4  2e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
103 aa  51.6  4e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  42.53 
 
 
108 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  40.22 
 
 
107 aa  50.4  7e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  38.2 
 
 
107 aa  50.1  9e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  32.91 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  34.38 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  34.69 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  29.67 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  28.87 
 
 
109 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>