More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0910 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  97.9 
 
 
381 aa  723  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  87.7 
 
 
381 aa  650  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
381 aa  756  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  72.85 
 
 
381 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  70.91 
 
 
383 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  70.65 
 
 
383 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  68.93 
 
 
379 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  68.93 
 
 
379 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  69.19 
 
 
379 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  72.06 
 
 
379 aa  516  1e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  68.93 
 
 
379 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  68.67 
 
 
379 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  73.11 
 
 
380 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  73.37 
 
 
380 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  70.21 
 
 
374 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  68.15 
 
 
379 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  61.82 
 
 
379 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  59.03 
 
 
376 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  54.88 
 
 
392 aa  399  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  53.57 
 
 
383 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  54.24 
 
 
383 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  54.55 
 
 
384 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  52.03 
 
 
386 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.55 
 
 
384 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  51.75 
 
 
383 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  51.52 
 
 
386 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  7.30188e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  52.76 
 
 
409 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  52.76 
 
 
409 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  52.76 
 
 
391 aa  356  4e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  51.36 
 
 
391 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  51.75 
 
 
380 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  51.02 
 
 
380 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  51.63 
 
 
390 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  51.25 
 
 
380 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.66 
 
 
375 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  50.25 
 
 
384 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  52.41 
 
 
386 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  51.5 
 
 
380 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  51.89 
 
 
414 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  50 
 
 
384 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  51.27 
 
 
380 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  50 
 
 
384 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  51.27 
 
 
380 aa  342  6e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  51.5 
 
 
379 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  49.75 
 
 
384 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.38 
 
 
384 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.26 
 
 
375 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 
383 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.85 
 
 
383 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.62 
 
 
381 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  49.74 
 
 
375 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  49.74 
 
 
375 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  49.61 
 
 
411 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  51.72 
 
 
383 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.87 
 
 
384 aa  327  2e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.87 
 
 
384 aa  327  2e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.87 
 
 
384 aa  327  2e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.49 
 
 
384 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
386 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  50.54 
 
 
375 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  51.19 
 
 
409 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  48.99 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  50.26 
 
 
396 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  48.21 
 
 
394 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
377 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  46.84 
 
 
383 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  50.76 
 
 
374 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  47.86 
 
 
394 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  50.76 
 
 
374 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  50.76 
 
 
374 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.62 
 
 
377 aa  314  2e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  47.55 
 
 
386 aa  313  3e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  50.75 
 
 
376 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  50.75 
 
 
376 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  50.75 
 
 
376 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  50.75 
 
 
376 aa  313  4e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  46.91 
 
 
386 aa  313  4e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  50.51 
 
 
374 aa  311  8e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  46.45 
 
 
387 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  47.59 
 
 
471 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  48.66 
 
 
385 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.14 
 
 
385 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.89 
 
 
385 aa  310  3e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  48.89 
 
 
384 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.96 
 
 
403 aa  309  6e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  50 
 
 
383 aa  308  1e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  50.89 
 
 
374 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.38 
 
 
363 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  52.32 
 
 
361 aa  303  3e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.89 
 
 
383 aa  303  4e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>