41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0870 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  985    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  46.75 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  43.84 
 
 
490 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  40.24 
 
 
489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  32.94 
 
 
515 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  34.06 
 
 
487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  27.97 
 
 
492 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  28.3 
 
 
481 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  28.96 
 
 
483 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  27.35 
 
 
478 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  28.45 
 
 
480 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  26.72 
 
 
482 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  27.91 
 
 
482 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  26.57 
 
 
482 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  27.4 
 
 
488 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  27.25 
 
 
494 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  27.85 
 
 
481 aa  141  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  26.81 
 
 
510 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  26.59 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  28.31 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  26.51 
 
 
412 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  25.98 
 
 
510 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  26.8 
 
 
486 aa  117  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25.89 
 
 
485 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  27.9 
 
 
489 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  26.09 
 
 
482 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  27.86 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  28.7 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  26.86 
 
 
499 aa  77  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  22.96 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  22.34 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  24.38 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  26.13 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25.26 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  32.06 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  25.11 
 
 
450 aa  63.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.42 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  23.35 
 
 
511 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  20.73 
 
 
485 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  22.06 
 
 
480 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  22.06 
 
 
480 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>