More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0742 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  100 
 
 
285 aa  580  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  96.49 
 
 
285 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  85.66 
 
 
286 aa  493  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
341 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
288 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
288 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.51 
 
 
288 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
288 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
288 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  80.88 
 
 
288 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  83.59 
 
 
285 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  83.21 
 
 
285 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  79.78 
 
 
288 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  83.21 
 
 
285 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  82.82 
 
 
285 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  81.32 
 
 
285 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  81.68 
 
 
285 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  81.32 
 
 
285 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  61.32 
 
 
302 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  60.22 
 
 
300 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  62.36 
 
 
295 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.94 
 
 
300 aa  307  1e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.58 
 
 
300 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  54.83 
 
 
255 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.68 
 
 
259 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.89 
 
 
274 aa  285  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  54.37 
 
 
275 aa  284  2e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.99 
 
 
275 aa  282  4e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  53.99 
 
 
275 aa  282  6e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.07 
 
 
268 aa  281  8e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  54.58 
 
 
277 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  54.15 
 
 
267 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  54.15 
 
 
267 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  53.23 
 
 
268 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  53.23 
 
 
268 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  53.23 
 
 
268 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  53.23 
 
 
268 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.94 
 
 
261 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  53.23 
 
 
268 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  52.47 
 
 
266 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  52.47 
 
 
268 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.09 
 
 
275 aa  275  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  52.09 
 
 
268 aa  274  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.9 
 
 
277 aa  273  2e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.83 
 
 
263 aa  274  2e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  52.09 
 
 
266 aa  272  4e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.09 
 
 
268 aa  271  8e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.81 
 
 
269 aa  271  8e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  48.9 
 
 
269 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.63 
 
 
273 aa  270  3e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.74 
 
 
270 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.74 
 
 
272 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  48.35 
 
 
255 aa  265  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.52 
 
 
264 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  50.37 
 
 
272 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4007  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  52.63 
 
 
271 aa  258  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.751788  hitchhiker  5.36443e-08 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4150  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.18 
 
 
271 aa  258  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0818457  normal  0.243283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.69 
 
 
266 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.266567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.61 
 
 
272 aa  254  1e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0542286  hitchhiker  4.83539e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3895  HesA/MoeB/ThiF family protein  52.61 
 
 
267 aa  253  2e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0735  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.24 
 
 
277 aa  252  5e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.349045  decreased coverage  3.65596e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.69 
 
 
267 aa  252  5e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.69 
 
 
270 aa  252  5e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.06 
 
 
269 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.06 
 
 
269 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65754  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.06 
 
 
269 aa  251  8e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.456786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.06 
 
 
269 aa  251  8e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859159  hitchhiker  1.17233e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0763  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.24 
 
 
272 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.568059  unclonable  2.13544e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0780  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.89 
 
 
270 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  49.61 
 
 
276 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3258  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.71 
 
 
268 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01865  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.64 
 
 
258 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  49.1 
 
 
271 aa  244  1e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  52.69 
 
 
270 aa  234  2e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2895  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.78 
 
 
274 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.63 
 
 
264 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.16 
 
 
269 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.64 
 
 
247 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.49 
 
 
264 aa  224  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50 
 
 
276 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  50.38 
 
 
270 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.67 
 
 
265 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.39 
 
 
269 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
269 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
271 aa  221  1e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.4 
 
 
270 aa  221  1e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  46.51 
 
 
276 aa  220  2e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1726  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.54 
 
 
260 aa  220  2e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0402438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3397  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.62 
 
 
275 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.056672  normal  0.0184534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3064  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
269 aa  219  4e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.04 
 
 
262 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1988  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.71 
 
 
284 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337161  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3049  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  44.1 
 
 
270 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.34 
 
 
277 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>