173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0687 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  94.76 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  82.38 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  77.87 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  77.87 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  77.87 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  77.87 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  77.87 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  77.46 
 
 		 251 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  79.92 
 
 		 251 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  76.64 
 
 		 253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  78.01 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  78.01 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  77.59 
 
 		 249 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  77.59 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  77.59 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  77.59 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  77.59 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  65.55 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  59.59 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  59.57 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  58.16 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  59 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  48.72 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  52.4 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  51.92 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  43.5 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  49.01 
 
 		 288 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  47.52 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  40.83 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  45.5 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  45.6 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  41.6 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  40.67 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  35.5 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  35.75 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  35.91 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  35.24 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  33.33 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.24 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  31.76 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  31.17 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  30.91 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  31.08 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.13 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  31.47 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.87 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.48 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.69 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  31.36 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.16 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  30 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  27.68 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  28.05 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  26.75 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.03 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  25.86 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  26.2 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  30.34 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.9 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.85 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  30.6 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  30.6 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  25.85 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  25.85 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  25.85 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.85 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  26.09 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  26.09 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.8 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  25.42 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  25.61 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.83 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.44 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.44 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  30.09 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  26.81 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  26.81 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  26.55 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  25.75 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  27.4 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  24.77 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  24.22 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  24.22 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.43 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  24 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  26.2 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  30.57 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  27.97 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  31.37 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  23.64 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  31.37 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  23.53 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  26.2 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  23.17 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  25.21 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  23.53 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  23.53 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  26.28 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.65 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>