More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0680 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  93.67 
 
 
569 aa  1016  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  66.49 
 
 
588 aa  727  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  66.43 
 
 
564 aa  724  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  72.18 
 
 
572 aa  679  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  65.86 
 
 
593 aa  712  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  76.8 
 
 
562 aa  866  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  67.88 
 
 
589 aa  681  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  67.88 
 
 
589 aa  682  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  66.49 
 
 
588 aa  727  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  100 
 
 
590 aa  1186  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  72.18 
 
 
572 aa  679  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  72.18 
 
 
572 aa  679  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  65.73 
 
 
564 aa  714  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  65.56 
 
 
564 aa  713  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  72.18 
 
 
572 aa  679  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  66.67 
 
 
588 aa  715  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  71.6 
 
 
589 aa  693  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  72.18 
 
 
560 aa  678  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  50.61 
 
 
561 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  50.41 
 
 
569 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
567 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  45.59 
 
 
605 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  45.15 
 
 
573 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  42.03 
 
 
562 aa  356  7e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  40.08 
 
 
565 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 
502 aa  283  6e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 
479 aa  271  3e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  36.86 
 
 
483 aa  260  5e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.4 
 
 
473 aa  215  1e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  34.74 
 
 
518 aa  213  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.48 
 
 
484 aa  208  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  32.64 
 
 
477 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  33.14 
 
 
533 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  47.35 
 
 
553 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
521 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  32.84 
 
 
478 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 
477 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 
478 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  33.75 
 
 
477 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.10651e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 
478 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  33.47 
 
 
477 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 
478 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  32.42 
 
 
477 aa  202  1e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  43.88 
 
 
521 aa  202  1e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  43.88 
 
 
521 aa  202  2e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  37.67 
 
 
548 aa  202  2e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
475 aa  199  8e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.45 
 
 
500 aa  198  2e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  42.54 
 
 
541 aa  197  4e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  33.69 
 
 
477 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 
554 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.02 
 
 
503 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.54 
 
 
549 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  40.2 
 
 
514 aa  188  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.87 
 
 
474 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  39.93 
 
 
480 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 
486 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 
487 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 
488 aa  178  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 
489 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.12 
 
 
484 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
485 aa  170  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 
487 aa  170  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.25556e-05  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 
486 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  32.82 
 
 
486 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.09 
 
 
484 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.87 
 
 
483 aa  167  6e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  1.08832e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 
489 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  33.48 
 
 
490 aa  166  1e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
485 aa  166  1e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  30.35 
 
 
488 aa  165  2e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  32.79 
 
 
489 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.77 
 
 
486 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 
487 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  28.27 
 
 
484 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  34.09 
 
 
489 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  41.28 
 
 
525 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 
490 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  32.67 
 
 
411 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.33 
 
 
494 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.73921e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.33 
 
 
494 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 
524 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  29.09 
 
 
478 aa  155  3e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 
566 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  29.09 
 
 
478 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.45 
 
 
487 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.45 
 
 
483 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  30.79 
 
 
481 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
487 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  28.51 
 
 
487 aa  148  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  28.51 
 
 
487 aa  148  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  28.51 
 
 
487 aa  148  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  35.15 
 
 
494 aa  147  7e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  25.88 
 
 
481 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>