More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0645 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  94.97 
 
 
457 aa  855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
454 aa  900    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  70.75 
 
 
438 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  71.14 
 
 
438 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  54.15 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 
427 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.93 
 
 
425 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 
443 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  52.02 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  52.34 
 
 
425 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  52.02 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  52.09 
 
 
425 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  52.02 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  52.02 
 
 
425 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  51.8 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  51.78 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  50.7 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  52.1 
 
 
425 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  48.87 
 
 
442 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  48.85 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  49.54 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  47.36 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  49.54 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  48.17 
 
 
429 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  49.31 
 
 
428 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  49.31 
 
 
428 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  48.51 
 
 
428 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  50.25 
 
 
461 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  49.08 
 
 
428 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  46.76 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  46.76 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  46.76 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  46.76 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  47.79 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  46.53 
 
 
435 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
444 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
425 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  46.76 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.97 
 
 
430 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  46.68 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  47.56 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  45.95 
 
 
440 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  43.94 
 
 
452 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  47.56 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  46.54 
 
 
430 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  47.33 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  47.56 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  45.37 
 
 
435 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  47.56 
 
 
430 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  47.56 
 
 
430 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  45.37 
 
 
425 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  48.79 
 
 
417 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 
424 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.3 
 
 
435 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  47.36 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  44.77 
 
 
413 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  44.77 
 
 
413 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  46.85 
 
 
431 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  44.01 
 
 
438 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  44.01 
 
 
438 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  44.47 
 
 
438 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  43.78 
 
 
438 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  44.34 
 
 
438 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  44.5 
 
 
436 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  44.5 
 
 
436 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  45.84 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.04 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  42.63 
 
 
436 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  42.52 
 
 
438 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
438 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  42.82 
 
 
436 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  45.19 
 
 
439 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  44.58 
 
 
439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
452 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.43 
 
 
452 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  44.5 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  42.33 
 
 
438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.93 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  39.95 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  41.91 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.46 
 
 
443 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.46 
 
 
443 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 
439 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  43.41 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  43.03 
 
 
420 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  43.4 
 
 
433 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
445 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  42.76 
 
 
443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  39.27 
 
 
449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  41.74 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  41.34 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  40.32 
 
 
431 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>