More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0534 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  91.11 
 
 
183 aa  337  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  69.23 
 
 
182 aa  243  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  63.52 
 
 
182 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  63.52 
 
 
182 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  61.25 
 
 
183 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  63.29 
 
 
182 aa  208  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  62.89 
 
 
183 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  61.25 
 
 
184 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  66.67 
 
 
183 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  59.26 
 
 
202 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  59.26 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  59.26 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  59.88 
 
 
186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  59.88 
 
 
186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  59.88 
 
 
186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  59.88 
 
 
186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  58.64 
 
 
202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.82 
 
 
174 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  45.71 
 
 
174 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  42.7 
 
 
174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  48.57 
 
 
180 aa  147  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  46.43 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.18 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  39.11 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  44.29 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  40.26 
 
 
171 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.63 
 
 
195 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  40.15 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.71 
 
 
195 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  40.71 
 
 
195 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  40.85 
 
 
188 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.42 
 
 
182 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  39.16 
 
 
172 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  46.49 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  41.73 
 
 
190 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  35.56 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  40.74 
 
 
184 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.67 
 
 
187 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  39.17 
 
 
167 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  42.86 
 
 
135 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  35.61 
 
 
165 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  37.23 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.68 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.73 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  36.11 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.87 
 
 
188 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.46 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.42 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  33.15 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  33.33 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  39.23 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.1 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.72 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  33.6 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  39.69 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.72 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.73 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  33.58 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  34.88 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.7 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.61 
 
 
170 aa  82  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.13 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.01 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  36.84 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.04 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  37.07 
 
 
447 aa  80.9  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  35.9 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.33 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  34.25 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  39.84 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
655 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.24 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  36.07 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.05 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  34.35 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.94 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.67 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.54 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00935  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like protein  37.93 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  33.85 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.17 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  36.36 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  35.34 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  35.11 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  37.5 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  31.18 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
433 aa  77.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  33.86 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  33.55 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.09 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  35.85 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>