245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0266 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.91 
 
 
296 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  71.85 
 
 
336 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  64.95 
 
 
307 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  64.63 
 
 
307 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  63.99 
 
 
309 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  63.99 
 
 
307 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  63.99 
 
 
309 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  65.27 
 
 
307 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  65.8 
 
 
306 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  65.8 
 
 
323 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  64.31 
 
 
307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  64.4 
 
 
307 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  51.52 
 
 
323 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  53.9 
 
 
308 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  53.79 
 
 
297 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  47.89 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.85 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  46.85 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  46.5 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  47.45 
 
 
312 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  46.5 
 
 
295 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  46.15 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  45.8 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  47.54 
 
 
298 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44 
 
 
294 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.58 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  36.9 
 
 
293 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  41.64 
 
 
320 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.52 
 
 
287 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  36.7 
 
 
303 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  36.09 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  37.05 
 
 
300 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  34.25 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.21 
 
 
293 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  36.75 
 
 
296 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.08 
 
 
303 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.08 
 
 
303 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.08 
 
 
303 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.08 
 
 
303 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.08 
 
 
303 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  28.76 
 
 
301 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.76 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.97 
 
 
301 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  28.43 
 
 
303 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  28.34 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.13 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.12 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  34.95 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
301 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.36 
 
 
298 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
302 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  28.95 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.57 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  31.79 
 
 
305 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  33.2 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 
290 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
343 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
293 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.57 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
308 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  28.72 
 
 
292 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.86 
 
 
299 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
292 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  32.99 
 
 
299 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  27.15 
 
 
286 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  30.41 
 
 
305 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.37 
 
 
289 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
312 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.37 
 
 
298 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
297 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
301 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  32.37 
 
 
288 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
252 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25.32 
 
 
306 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  27.12 
 
 
294 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.25 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.56 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  26.86 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.89 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.89 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.03 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>