More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0239 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  100 
 
 
94 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  70.83 
 
 
94 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  48.91 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.09 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  46.74 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  52.33 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  51.09 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  48.91 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  57.14 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  55.71 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  52.17 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  48.91 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  58.21 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  55.71 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  44.68 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  54.29 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  46.74 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  48.89 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  43.3 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  43.68 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  49.3 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  44.32 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  45.26 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  46.59 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  43.75 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  44.74 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  39.18 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
750 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
861 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  45.61 
 
 
61 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
806 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.83 
 
 
833 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  48.53 
 
 
1087 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
866 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
871 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
849 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
753 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
802 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
836 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
823 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
976 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
838 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
837 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
834 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
885 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.79 
 
 
751 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
825 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
887 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
938 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
752 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
814 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
847 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
816 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
791 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
826 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
820 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
826 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
786 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
866 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
821 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
836 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
821 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
813 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1071 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
94 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
754 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
824 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  35.82 
 
 
851 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
748 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
801 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
837 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
835 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
830 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
837 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
872 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  38.82 
 
 
765 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
837 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
759 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
890 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
831 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
767 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>