41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0212 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  756    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.37 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  37.57 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.64 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  36.89 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.68 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.22 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  35.28 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  32.71 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  35.05 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.93 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.81 
 
 		 350 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.78 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.33 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.86 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.02 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.36 
 
 		 228 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.47 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.97 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.21 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.45 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  25.07 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.1 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  26.71 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  34.02 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  24.7 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 		 101 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 101 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 		 124 aa  49.7  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  28.23 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.49 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.49 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  31.58 
 
 		 95 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  28.57 
 
 		 111 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 98 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  34.31 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>