More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0100 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  54.99 
 
 
821 aa  838  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  47.07 
 
 
797 aa  694  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  100 
 
 
790 aa  1625  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  50.07 
 
 
780 aa  774  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  54.99 
 
 
776 aa  838  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  54.86 
 
 
776 aa  838  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  49.55 
 
 
781 aa  762  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  54.99 
 
 
821 aa  837  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  54.99 
 
 
776 aa  838  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  54.99 
 
 
776 aa  838  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  49.21 
 
 
779 aa  752  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  54.99 
 
 
776 aa  838  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.29 
 
 
790 aa  1502  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  50.07 
 
 
780 aa  774  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 
1143 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.73 
 
 
585 aa  328  2e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  35.87 
 
 
1116 aa  323  1e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.98 
 
 
1106 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
717 aa  314  3e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
717 aa  313  8e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
974 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  32.57 
 
 
1144 aa  312  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 
789 aa  310  7e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 
699 aa  309  1e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 
589 aa  306  1e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
1106 aa  303  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
789 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
647 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.63 
 
 
589 aa  297  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.81 
 
 
1221 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
633 aa  290  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
627 aa  286  1e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
754 aa  286  2e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
828 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
1714 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
708 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  36.31 
 
 
937 aa  281  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
822 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
968 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
754 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
828 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  32.82 
 
 
715 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
828 aa  276  1e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 
723 aa  275  2e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.46 
 
 
708 aa  275  2e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
713 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 
796 aa  268  3e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
732 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
619 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
595 aa  263  9e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 
598 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.19 
 
 
667 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
824 aa  257  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 
529 aa  256  1e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
734 aa  252  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.45 
 
 
739 aa  247  5e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.36 
 
 
739 aa  247  7e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
833 aa  246  1e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
693 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.21 
 
 
739 aa  241  3e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
626 aa  240  6e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
833 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
718 aa  236  1e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
727 aa  234  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  29.52 
 
 
1415 aa  233  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  28.86 
 
 
921 aa  229  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  30.07 
 
 
596 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
4489 aa  224  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
1085 aa  220  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.91 
 
 
742 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
1094 aa  212  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
633 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.03 
 
 
816 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
739 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.03 
 
 
740 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
909 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
808 aa  204  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
733 aa  203  1e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.2 
 
 
552 aa  201  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.25 
 
 
553 aa  197  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
750 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
667 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
3035 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
700 aa  191  3e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
3560 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  30.1 
 
 
560 aa  186  1e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  28.95 
 
 
568 aa  180  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
616 aa  179  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
574 aa  179  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
761 aa  176  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
740 aa  176  2e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
654 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
618 aa  172  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
811 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
672 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
632 aa  168  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 
793 aa  166  1e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
724 aa  163  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  26.67 
 
 
680 aa  162  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
647 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>