61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0092 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  89.22 
 
 		 334 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  45.99 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  45.25 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  40.2 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  37.66 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  29.8 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  27.78 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  26.25 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.83 
 
 		 300 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  29.08 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  28.62 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  30.16 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  26.55 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  28.26 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  26.85 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  26.52 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.73 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  25.78 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  29.07 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  26.76 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  29.1 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  27.56 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  27 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  29.65 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  27.44 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  28 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.39 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  25.54 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  24.82 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  26.51 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  27.75 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  27.33 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  27.87 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  25.15 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  26.19 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  24.85 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  24.85 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  32.86 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  28.92 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  29.41 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  25.51 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  33.57 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.9 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.41 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  25.41 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  32.09 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  31.45 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  25.27 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  25.1 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2099  Protein involved in meta-pathway of phenol degradation  29.51 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119201  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  26.22 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  32.5 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  24.49 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  23.63 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  22.47 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  29.01 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>