More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0086 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  100 
 
 		 335 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  94.93 
 
 		 335 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  55.12 
 
 		 322 aa  362  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  52.28 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  52.34 
 
 		 328 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  53.21 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  48.96 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  52.29 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  47.43 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  49.7 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  45.51 
 
 		 329 aa  311  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  45.51 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  48.02 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  48.43 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.71 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.71 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  47.42 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  44.71 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  44.95 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  46.52 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  42.9 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  43.69 
 
 		 336 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  45 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  45.63 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  45 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  36.31 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.45 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.93 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  37.55 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  33.23 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.02 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.83 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  32.37 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  31.73 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  31.73 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.35 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  33.63 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.8 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  34.28 
 
 		 369 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  37.3 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.63 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  30.23 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  30.23 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.77 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.89 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  34.57 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  32.06 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  36 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  34.86 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.29 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  31.66 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  29.52 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  30.65 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  39.44 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  34.29 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.2 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.27 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  33.05 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.26 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  30.29 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  29.15 
 
 		 370 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.27 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.5 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  28.16 
 
 		 388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  29.39 
 
 		 430 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 		 419 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  30.21 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  25.17 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 651 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 		 750 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  32.95 
 
 		 804 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  30.24 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.29 
 
 		 718 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.35 
 
 		 659 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  30.66 
 
 		 599 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 731 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.88 
 
 		 760 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.89 
 
 		 759 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.88 
 
 		 735 aa  102  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 731 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.74 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  31.82 
 
 		 754 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32 
 
 		 731 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.91 
 
 		 736 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.06 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  33.64 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.68 
 
 		 800 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.22 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.91 
 
 		 669 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.87 
 
 		 731 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  35.14 
 
 		 637 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.46 
 
 		 673 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  35.94 
 
 		 652 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>