238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0082 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  100 
 
 		 497 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  86.32 
 
 		 497 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  100 
 
 		 497 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  100 
 
 		 497 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  51.52 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  53.23 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  49.8 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  49.8 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  49.8 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  49.8 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  49.8 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  51.1 
 
 		 532 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  51 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  50.5 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 504 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 504 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 504 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  50.1 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  50.1 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  50.3 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  50.2 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  42.6 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  53.28 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  40.44 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  41.01 
 
 		 500 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  44.25 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  45.45 
 
 		 245 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  44.93 
 
 		 226 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  81.37 
 
 		 102 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  34.04 
 
 		 240 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  34.04 
 
 		 240 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  48 
 
 		 159 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  27.75 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  26.55 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  27.71 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  27.71 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  27.71 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  27.71 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  25.21 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  24.66 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  25.56 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  25.56 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  25.56 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  25.56 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  50.75 
 
 		 98 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  26.7 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  26.7 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  26.17 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  26.88 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  25.21 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  26.6 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  26.6 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  26.6 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>