17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0075 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0075    100 
 
 
228 bp  452  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.222144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1942    94.7 
 
 
159 bp  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00202133  normal  0.100168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  85.06 
 
 
837 bp  69.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  85.06 
 
 
837 bp  69.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  92.11 
 
 
747 bp  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  82.72 
 
 
807 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  90.24 
 
 
837 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  100 
 
 
828 bp  46.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  100 
 
 
828 bp  46.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  100 
 
 
666 bp  46.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>