12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0064 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0064    100 
 
 
354 bp  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  100 
 
 
354 bp  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  100 
 
 
354 bp  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  100 
 
 
354 bp  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  84.09 
 
 
354 bp  254  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  81.28 
 
 
414 bp  101  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  95.24 
 
 
354 bp  67.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  78.28 
 
 
354 bp  58  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  92.68 
 
 
450 bp  58  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  92.31 
 
 
351 bp  54  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  86.44 
 
 
354 bp  54  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    85.71 
 
 
2921 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>