176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0061 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  92 
 
 		 300 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  77.12 
 
 		 319 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  70.13 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  70.33 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  70.33 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  70.33 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  70.33 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  70.33 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  69.67 
 
 		 299 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  68.87 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  68.54 
 
 		 302 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  68.79 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  68.79 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  68.79 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  65.44 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  68.77 
 
 		 300 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  69.09 
 
 		 275 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  59.71 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  55.52 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  56.66 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  56.55 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  53.45 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  50.49 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  53.24 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  51.01 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  55.9 
 
 		 167 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  39.78 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 163 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  0.00000795968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  48.81 
 
 		 183 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  50.93 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  49.69 
 
 		 180 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  50.63 
 
 		 174 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  48.43 
 
 		 179 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  48.43 
 
 		 180 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 180 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  47.4 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  34.7 
 
 		 206 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  35.39 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 148 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  41.6 
 
 		 136 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  49.45 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  50 
 
 		 225 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  42.65 
 
 		 137 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  47.52 
 
 		 103 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  52.05 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  26.54 
 
 		 537 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  26.54 
 
 		 537 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 147 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  48.19 
 
 		 112 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  46.46 
 
 		 135 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  41.96 
 
 		 173 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  47.73 
 
 		 157 aa  85.5  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  44.55 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  54.55 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  42.28 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  42.48 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  54.55 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  51.22 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  51.85 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  35.54 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  47.3 
 
 		 99 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  53.85 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  54.55 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  53.85 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 97 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  52.56 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  39.83 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  52.44 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  52.44 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  46.05 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  40.15 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  38.71 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  43.81 
 
 		 137 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  50.62 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  44.59 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  43.9 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  46.91 
 
 		 107 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  52 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  43.42 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  39.02 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  44.87 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>