234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5501 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  100 
 
 		 346 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.38 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  35.57 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  34.6 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.92 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.4 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  31.61 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  30.98 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  31.77 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  31.44 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  32.06 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  33.2 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.77 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  27.88 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.03 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  28.38 
 
 		 260 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  24.77 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.16 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  30.41 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  28.65 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  28.65 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  28.21 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  30.97 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  33.51 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.25 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  29.26 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  30.63 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  28.57 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  31.55 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.97 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  31.55 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  30 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  29.41 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  25.74 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  26.53 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.74 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  30.05 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.62 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  29.87 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.53 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  27.53 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.53 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  28.04 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  28.92 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  27.32 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.17 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  33.75 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.16 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  27.08 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.33 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  29.65 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.18 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.06 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.16 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  30.43 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  29.15 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.02 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.02 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.78 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.73 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.05 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.78 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  25.96 
 
 		 4917 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.36 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  29.52 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.08 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  27.54 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.43 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.67 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.99 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  28.57 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  26.36 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.83 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.49 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  29.59 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  26.09 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  28.83 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  28.8 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.51 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.94 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.16 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.29 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  30.52 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.92 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.08 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 		 855 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.11 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  26.77 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.92 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  25.85 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  25.42 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  26.78 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.54 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  29.61 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  28.4 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.5 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.47 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  30.91 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  27.75 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>