More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5490 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5490  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 587 aa  1223    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996527  normal  0.395354 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5096  UvrD/REP helicase  35.43 
 
 		 613 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 573 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 573 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6314  UvrD/REP helicase  31.95 
 
 		 579 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  33.17 
 
 		 571 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3677  UvrD/REP helicase  30.67 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0841788  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4315  UvrD/REP helicase  30.86 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2848  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 611 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.385626  normal  0.424075 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4281  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 606 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4204  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 599 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.89 
 
 		 659 aa  114  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.01 
 
 		 732 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.15 
 
 		 718 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 668 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 		 677 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 731 aa  107  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1693  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 683 aa  107  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.508868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.46 
 
 		 725 aa  107  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.98 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 681 aa  104  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.02 
 
 		 660 aa  104  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.19 
 
 		 690 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.74 
 
 		 670 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  25.55 
 
 		 634 aa  103  8e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.22 
 
 		 669 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  24.72 
 
 		 764 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 		 741 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.45 
 
 		 669 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.97 
 
 		 672 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.92 
 
 		 751 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.24 
 
 		 729 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.09 
 
 		 678 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  25.23 
 
 		 669 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 757 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.42 
 
 		 729 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.89 
 
 		 669 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.44 
 
 		 751 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.89 
 
 		 669 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.89 
 
 		 669 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.89 
 
 		 669 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.29 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 678 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.16 
 
 		 682 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  23.31 
 
 		 749 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 724 aa  96.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.09 
 
 		 667 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  25.12 
 
 		 658 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  25.89 
 
 		 671 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.84 
 
 		 772 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.07 
 
 		 675 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.04 
 
 		 728 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.15 
 
 		 707 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  26.55 
 
 		 671 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  26.56 
 
 		 673 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  26.56 
 
 		 673 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 674 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 674 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.19 
 
 		 674 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.87 
 
 		 674 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.56 
 
 		 673 aa  94.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 768 aa  94.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  24.78 
 
 		 669 aa  94  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.64 
 
 		 726 aa  94  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.88 
 
 		 658 aa  94  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.78 
 
 		 706 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  23.44 
 
 		 726 aa  93.6  9e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.58 
 
 		 728 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.01 
 
 		 673 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.78 
 
 		 669 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 762 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.34 
 
 		 669 aa  93.2  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 769 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 707 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.65 
 
 		 674 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.11 
 
 		 671 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 755 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 741 aa  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.56 
 
 		 794 aa  91.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 706 aa  91.3  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 		 730 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 		 730 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 778 aa  91.3  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.45 
 
 		 768 aa  90.5  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 665 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.13 
 
 		 625 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.73 
 
 		 691 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 679 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.26 
 
 		 672 aa  90.1  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 736 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>