32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5454 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5454  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  857    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131248  decreased coverage  0.00950425 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  30.89 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4251  hypothetical protein  25.94 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4757  hypothetical protein  27.57 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.46 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5549  hypothetical protein  35.44 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  41.43 
 
 		 269 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  37.66 
 
 		 599 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  42.19 
 
 		 277 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.53 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6567  hypothetical protein  31.87 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5006  lytic transglycosylase catalytic  32.04 
 
 		 136 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840995  normal  0.821315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1530  hypothetical protein  28.68 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5195  conserved hypothetical protein; putative PilL-like protein; putative exported protein  28.68 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  36.51 
 
 		 269 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.94 
 
 		 290 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  35.56 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  39.34 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  31.94 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  35.56 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  35.56 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  35.56 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  35.56 
 
 		 199 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.46 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  28.24 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.27 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>