240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5309 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  99.53 
 
 
238 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 
238 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  65.88 
 
 
243 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  62.76 
 
 
341 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  62.76 
 
 
263 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  51.92 
 
 
228 aa  214  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  50.96 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  50.96 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  50.48 
 
 
228 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  47.93 
 
 
227 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.39 
 
 
230 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.39 
 
 
230 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  48.39 
 
 
230 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  48.39 
 
 
230 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  49.25 
 
 
235 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  48.74 
 
 
235 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  48.24 
 
 
235 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  47.24 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  49.72 
 
 
215 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  46.12 
 
 
222 aa  184  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  50.6 
 
 
185 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  48.65 
 
 
236 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  50.6 
 
 
185 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  51.81 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  47.21 
 
 
218 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  45 
 
 
302 aa  174  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  45 
 
 
235 aa  174  9e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  46.88 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  44.72 
 
 
238 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  46.97 
 
 
255 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  50 
 
 
181 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  44.5 
 
 
254 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  44.5 
 
 
254 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  44.5 
 
 
264 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  44.9 
 
 
235 aa  168  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  42.79 
 
 
235 aa  166  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  46.02 
 
 
198 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  42 
 
 
235 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  43.08 
 
 
250 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  43.08 
 
 
250 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.22 
 
 
240 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.22 
 
 
234 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.22 
 
 
240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  42.86 
 
 
250 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  38.31 
 
 
246 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  41.54 
 
 
250 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  42.35 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  41.54 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  41.03 
 
 
259 aa  154  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  41.84 
 
 
237 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  40.72 
 
 
213 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  41.54 
 
 
236 aa  151  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  40.21 
 
 
213 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  38.46 
 
 
346 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  40.51 
 
 
250 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  39.18 
 
 
236 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  40.51 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  40.31 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40 
 
 
346 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  41.67 
 
 
224 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  39.18 
 
 
212 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  38.97 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  37.17 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  37.17 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  37.17 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.17 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  41.75 
 
 
262 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  37.7 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  41.21 
 
 
227 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  38.3 
 
 
214 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  39.36 
 
 
224 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  39.36 
 
 
224 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  39.36 
 
 
224 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  39.36 
 
 
224 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  38.22 
 
 
224 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>