156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5291 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5291  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 418 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5010  hypothetical protein  32.18 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3438  hypothetical protein  33.41 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0264  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  33.86 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.17 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2275  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.17 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1155  hypothetical protein  35.01 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0965806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3538  hypothetical protein  33.49 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000073392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2987  hypothetical protein  33.25 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3611  hypothetical protein  31.56 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.426846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0466  hypothetical protein  33.16 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0457  hypothetical protein  33.16 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.734895  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0565  hypothetical protein  31.91 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2221  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.93 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5035  hypothetical protein  32.9 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5149  hypothetical protein  31.4 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0218  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  33.16 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43510  hypothetical protein  32.63 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0230529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0552  hypothetical protein  32.63 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2770  hypothetical protein  32.54 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0600  hypothetical protein  31.58 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0783  hypothetical protein  30.7 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43720  hypothetical protein  34.03 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2984  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.54 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4295  hypothetical protein  31.32 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  decreased coverage  0.00229611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2721  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.99 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178646  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0052  Fis family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2752  hypothetical protein  32.42 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0380  high-affinity branched-chain amino acid transport system periplasmic binding protein livK  32.08 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.59 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1435  hypothetical protein  31.02 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  hitchhiker  0.00000490769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2751  hypothetical protein  33.59 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3001  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.34 
 
 		 444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0119  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein, putative  31.56 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3876  hypothetical protein  30.97 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0253  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.99 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0750632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3494  hypothetical protein  30.86 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4004  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid binding protein  31.45 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7159  hypothetical protein  32.98 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3802  hypothetical protein  30.39 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43750  hypothetical protein  33.25 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.675363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2547  hypothetical protein  30.87 
 
 		 429 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43730  hypothetical protein  31.96 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959668  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7160  hypothetical protein  31.56 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2949  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.22 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0366338  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5205  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.34 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2285  Extracellular ligand-binding receptor  23.89 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.399222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3839  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 397 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0951081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.99 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  21.66 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0626  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.45 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741534  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0404  Extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2445  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4065  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.69 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  21.1 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  21.33 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4681  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.14 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.3 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  32.14 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.39 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  21.29 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0756  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.2 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  22.77 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1462  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3027  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.73 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  23.67 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2721  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.71 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.368062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1291  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.46 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  21.31 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  21.78 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  21.76 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  21.38 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  22.48 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  22.98 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>