170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5278 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  55.56 
 
 
131 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  54.1 
 
 
129 aa  133  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  54.39 
 
 
127 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  54.39 
 
 
127 aa  131  4e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  54.39 
 
 
134 aa  127  8e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  53.39 
 
 
132 aa  126  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  54.7 
 
 
119 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  49.17 
 
 
128 aa  115  2e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  47.58 
 
 
127 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  46.15 
 
 
121 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  47.93 
 
 
123 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  41.38 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  40.46 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  38.39 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  39.84 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  41.35 
 
 
123 aa  83.6  1e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  38.93 
 
 
319 aa  81.6  3e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  81.6  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.76 
 
 
149 aa  79.3  2e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  40.78 
 
 
139 aa  78.6  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  37.72 
 
 
136 aa  77  7e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  35.85 
 
 
130 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  74.3  5e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  74.3  5e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  34.91 
 
 
130 aa  73.9  7e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  38.52 
 
 
125 aa  72.8  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  39.6 
 
 
132 aa  73.2  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  72.4  2e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  32.52 
 
 
130 aa  72.8  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.77 
 
 
138 aa  72.8  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  44.09 
 
 
136 aa  72.4  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  40.38 
 
 
120 aa  72  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  71.6  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  71.2  4e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  40.57 
 
 
120 aa  71.6  4e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  37.86 
 
 
143 aa  70.9  5e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  38.2 
 
 
144 aa  69.7  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  35.71 
 
 
130 aa  68.9  2e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  69.3  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  35.65 
 
 
137 aa  68.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.22 
 
 
132 aa  68.9  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.86 
 
 
137 aa  68.2  3e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  39.09 
 
 
145 aa  67.8  4e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  38 
 
 
146 aa  68.2  4e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  39.09 
 
 
145 aa  67.8  4e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  39.09 
 
 
145 aa  67.8  4e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  67.8  5e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.11 
 
 
137 aa  67.4  6e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  67  9e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  36.19 
 
 
142 aa  67  9e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  32.79 
 
 
132 aa  66.2  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.62 
 
 
132 aa  65.5  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.56 
 
 
132 aa  65.1  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.7 
 
 
311 aa  65.1  3e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  36.07 
 
 
132 aa  64.7  4e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  35.35 
 
 
132 aa  64.3  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  30.43 
 
 
128 aa  64.3  5e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  64.7  5e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  42.27 
 
 
145 aa  64.3  5e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  36.8 
 
 
136 aa  63.9  7e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  32.81 
 
 
137 aa  62.8  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  41.86 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.91 
 
 
137 aa  63.2  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  32.79 
 
 
132 aa  62.4  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  36.46 
 
 
152 aa  62  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  34.21 
 
 
137 aa  62  3e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 
144 aa  61.6  4e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.61 
 
 
319 aa  61.2  5e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.56 
 
 
148 aa  60.8  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  35.29 
 
 
134 aa  60.8  6e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1359  protein of unknown function DUF35  34.96 
 
 
125 aa  60.1  1e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.488871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  27.35 
 
 
189 aa  60.1  1e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.91 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  34.19 
 
 
417 aa  60.1  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  34.02 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  36.27 
 
 
131 aa  58.9  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  34.02 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  29.46 
 
 
128 aa  59.3  2e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.64 
 
 
141 aa  58.5  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  34.31 
 
 
417 aa  58.5  3e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  31.48 
 
 
124 aa  58.5  3e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  33.9 
 
 
141 aa  58.9  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.46433e-07  hitchhiker  6.44081e-06 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.09 
 
 
129 aa  58.2  4e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  34.04 
 
 
118 aa  58.2  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.17 
 
 
321 aa  58.2  4e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  58.2  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  35.59 
 
 
146 aa  58.2  4e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 
178 aa  58.2  4e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  38 
 
 
315 aa  57.8  5e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.01 
 
 
136 aa  57.4  6e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>