204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5254 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  277  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  42.28 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  37.12 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  41.86 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  38.28 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  38.28 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  37.21 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  45.22 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  37.01 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  40.94 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  40.94 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  40.16 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  41.54 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  38.46 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  37.98 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  44.07 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.92 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  43.65 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  36.92 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  34.48 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  37.21 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  42.28 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  41.82 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  40.77 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  43.22 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  37.4 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  38.66 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  41.54 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  39.84 
 
 		 319 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  34.43 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  39.68 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  36.21 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  34.88 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  36.44 
 
 		 311 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  38.52 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  41.12 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  38.4 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  35.38 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  35.38 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.83 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  35.34 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  35.38 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.06 
 
 		 321 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  48.42 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.4 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  36.64 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  36.72 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  46.08 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  46.08 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  34.68 
 
 		 319 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  37.01 
 
 		 315 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  44.12 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.33 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  32.52 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  37.04 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  32.59 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.31 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  38.1 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.54 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  38.17 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  36.51 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  37.14 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  42.72 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  39.45 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  38.04 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  35.61 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  33.98 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.55 
 
 		 312 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  40.2 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  35.14 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  32.69 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  32.31 
 
 		 550 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  32.31 
 
 		 550 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.31 
 
 		 550 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>