More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5181 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
307 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  99.02 
 
 
307 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  43.14 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  41.7 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  44.63 
 
 
315 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  41.28 
 
 
311 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  39 
 
 
318 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  32.35 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  37.34 
 
 
312 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
314 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
306 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  37.01 
 
 
312 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
314 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
314 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
307 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
314 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
306 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  30.26 
 
 
307 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 
314 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
314 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  39.06 
 
 
299 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
302 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  35.36 
 
 
312 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  35.69 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  37.41 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  35.34 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  35.34 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  36.73 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  37.85 
 
 
313 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
315 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 
315 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
300 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  36.25 
 
 
345 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  37.07 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  35.61 
 
 
312 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 
301 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  35.35 
 
 
313 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  32.23 
 
 
311 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  34.46 
 
 
317 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  34.16 
 
 
311 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
302 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  38.18 
 
 
319 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  38.18 
 
 
319 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.38 
 
 
306 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.1 
 
 
311 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
321 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 
306 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  35.4 
 
 
314 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
321 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 
306 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 
326 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.77 
 
 
298 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 
326 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
310 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  32.98 
 
 
305 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
306 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 
327 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  32.32 
 
 
315 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
312 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  36.1 
 
 
317 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.61 
 
 
304 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 
325 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 
301 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
308 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  31.97 
 
 
335 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  35.22 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 
315 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
324 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.1 
 
 
325 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  30.12 
 
 
331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  31.87 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.66 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.67 
 
 
335 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
325 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
332 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
313 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>