28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5161 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  70.76 
 
 		 300 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  70.43 
 
 		 300 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  68.11 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  44.22 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  25.57 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  25.5 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  26.62 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  25.47 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  26.85 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  25.32 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  24.67 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  29.6 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  25.44 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  23.25 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  27.23 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  26.99 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  22.83 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  27.23 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  22.51 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  21.09 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  23.97 
 
 		 434 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2015  hypothetical protein  25.96 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0355  hypothetical protein  23.53 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  21.99 
 
 		 423 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  24.89 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>