More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5107 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  79.78 
 
 		 534 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  98.01 
 
 		 502 aa  1025    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 534 aa  1112    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  50 
 
 		 532 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  49.81 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  49.72 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  49.25 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.16 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  49.43 
 
 		 527 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.06 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.17 
 
 		 527 aa  279  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  32.98 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.21 
 
 		 563 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  34.06 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  34.06 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  34.06 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.77 
 
 		 550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.35 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  34.11 
 
 		 532 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.56 
 
 		 521 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.4 
 
 		 531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  34.48 
 
 		 521 aa  246  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  30.84 
 
 		 584 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.66 
 
 		 572 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 533 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  32.7 
 
 		 527 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  31.35 
 
 		 556 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  32.84 
 
 		 545 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30 
 
 		 557 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.4 
 
 		 540 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.62 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.19 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  30.69 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  29.96 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  29.26 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  34.2 
 
 		 520 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 		 565 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  28.38 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.92 
 
 		 579 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  27.4 
 
 		 583 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.08 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  28.6 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.97 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.95 
 
 		 520 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  25.67 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.29 
 
 		 564 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.31 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 516 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  28.1 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  27.09 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.1 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 510 aa  140  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.6 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  26.25 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.7 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  25.23 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.05 
 
 		 460 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.42 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.79 
 
 		 470 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.79 
 
 		 470 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.05 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.05 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.09 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.79 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.79 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.19 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  26.79 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.37 
 
 		 470 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 459 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.89 
 
 		 460 aa  127  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.83 
 
 		 459 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 469 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.88 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.47 
 
 		 470 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.37 
 
 		 470 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.1 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  25.11 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.16 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.21 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.8 
 
 		 475 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.23 
 
 		 463 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>