More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5105 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  662  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  81.76 
 
 
346 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  52.04 
 
 
325 aa  335  6e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  47.81 
 
 
324 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.51 
 
 
328 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.51 
 
 
328 aa  295  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.36 
 
 
336 aa  282  6e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.49 
 
 
339 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.99 
 
 
328 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.84 
 
 
330 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.34 
 
 
332 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.73 
 
 
327 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.84 
 
 
330 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.75 
 
 
330 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.08 
 
 
320 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.48 
 
 
327 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.43 
 
 
330 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.08 
 
 
332 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.08 
 
 
344 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.28 
 
 
349 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48 
 
 
328 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.9 
 
 
335 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47 
 
 
324 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  40.43 
 
 
337 aa  274  1e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.2 
 
 
330 aa  273  2e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.48 
 
 
322 aa  274  2e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  46 
 
 
356 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.81 
 
 
360 aa  273  4e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.19 
 
 
339 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.48 
 
 
339 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.57 
 
 
330 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.55 
 
 
327 aa  271  8e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.09 
 
 
326 aa  270  3e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.53 
 
 
323 aa  270  3e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  42.63 
 
 
344 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.46 
 
 
333 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.37 
 
 
330 aa  269  6e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.04 
 
 
322 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.36 
 
 
323 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.47 
 
 
337 aa  266  3e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.71 
 
 
314 aa  266  3e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.92 
 
 
328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
335 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.49 
 
 
320 aa  265  6e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.68 
 
 
325 aa  265  6e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.98 
 
 
345 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.98 
 
 
345 aa  265  9e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.38 
 
 
331 aa  265  9e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43.48 
 
 
343 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.15 
 
 
339 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.05 
 
 
331 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.81 
 
 
338 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  43.71 
 
 
338 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.86 
 
 
325 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.86 
 
 
327 aa  262  5e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  44.15 
 
 
336 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
331 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  42.62 
 
 
334 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.95 
 
 
339 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.24 
 
 
352 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.81 
 
 
321 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.64 
 
 
328 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 
330 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.14 
 
 
325 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  42.72 
 
 
336 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 
314 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.77 
 
 
327 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.16 
 
 
330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.85 
 
 
328 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.38 
 
 
331 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  43.38 
 
 
332 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  42.43 
 
 
324 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.44 
 
 
333 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.44 
 
 
333 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.42 
 
 
331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.99 
 
 
330 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 
325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 
322 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 
339 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.16 
 
 
326 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.98 
 
 
322 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  43.81 
 
 
331 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.78 
 
 
334 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.47 
 
 
317 aa  254  1e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.57 
 
 
333 aa  254  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.62 
 
 
344 aa  254  1e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.81 
 
 
322 aa  254  1e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.44 
 
 
331 aa  254  1e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  43.2 
 
 
335 aa  254  1e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  41.72 
 
 
324 aa  254  1e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.47 
 
 
335 aa  254  2e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.53 
 
 
349 aa  254  2e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.48 
 
 
324 aa  254  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.11 
 
 
332 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.33 
 
 
333 aa  253  4e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>