More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5043 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  45.75 
 
 
229 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  31.8 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.05 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  32.87 
 
 
213 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  32.87 
 
 
213 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  31.34 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  32.39 
 
 
213 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 
215 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.26 
 
 
211 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  33.98 
 
 
216 aa  92  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  29.96 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  27.98 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  24.77 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.64 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  23.85 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.7 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  29.55 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  29.59 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.19 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  33.91 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.19 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.91 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.19 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.69 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  29 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.55 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  23.39 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  24.09 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  26.73 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.8 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.33 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2816  plasmid partition protein ParA-like  27.91 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.15 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4947  ATPase involved in chromosome partitioning  29.09 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.712893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.21 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.65 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.15 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  34.75 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  35.65 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.08 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>