More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4936 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
443 aa  910    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 
435 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  45.31 
 
 
442 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  45.93 
 
 
464 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  45.08 
 
 
423 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
433 aa  359  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 
440 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 
428 aa  259  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  35.07 
 
 
430 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
390 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
389 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
370 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
370 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
395 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
361 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
377 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  34.09 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
375 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
382 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
374 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
431 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
355 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
373 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
389 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
364 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
378 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
382 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
364 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
381 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
380 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  31.29 
 
 
375 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
398 aa  132  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  31.5 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
434 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.96 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.49 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
382 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
340 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
384 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  31.87 
 
 
353 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  30.6 
 
 
373 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
369 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
371 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
378 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
395 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.57 
 
 
374 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
357 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
372 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
373 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
360 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
366 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
381 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.72 
 
 
380 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
383 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
378 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  31.99 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.82 
 
 
351 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
397 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
378 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
1261 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
381 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.57 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  30.39 
 
 
1232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  28.77 
 
 
375 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
371 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.45 
 
 
1219 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>