More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4906 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  233  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  72.45 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  71.13 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  69.23 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  66.67 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  70.1 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  65.48 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  67.05 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  71.43 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  58.82 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  62.2 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  60.87 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  57.14 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  59.72 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  58.44 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  62.5 
 
 		 101 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  60.29 
 
 		 75 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  56.94 
 
 		 88 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  51.14 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  60.27 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  42.86 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  62.3 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  51.43 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  57.58 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60.32 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  56.16 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  50.63 
 
 		 73 aa  90.1  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50.6 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  57.35 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  52.24 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  42.05 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  53.33 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  57.58 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 		 76 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  61.76 
 
 		 76 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  64.62 
 
 		 76 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  49.32 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  61.76 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  58.73 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  58.73 
 
 		 84 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  53.03 
 
 		 214 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 		 79 aa  87.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  58.73 
 
 		 84 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.35 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.73 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  51.43 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50.65 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  51.69 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  56.72 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  52.17 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  48.72 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  54.41 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  55.56 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  51.47 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  56.45 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  48.05 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2121  hypothetical protein  48.24 
 
 		 88 aa  83.6  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  52.56 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.11 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  48.57 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  46.34 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  55.22 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  49.28 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  57.14 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>