More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4829 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  85.71 
 
 
473 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  68.48 
 
 
464 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  100 
 
 
462 aa  954    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  68.04 
 
 
469 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  66.23 
 
 
460 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3306  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain protein  67.24 
 
 
463 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3957  aminopeptidase P  67.24 
 
 
721 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4582  aminopeptidase P  67.17 
 
 
463 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  62.99 
 
 
454 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  60.65 
 
 
458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  60.69 
 
 
459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  59.01 
 
 
458 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  60.48 
 
 
474 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0195  peptidase M24  63.64 
 
 
466 aa  552  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  60.35 
 
 
465 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  59.05 
 
 
462 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  57.73 
 
 
499 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  58.46 
 
 
461 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  57.3 
 
 
464 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  59.44 
 
 
642 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  57.08 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  59.23 
 
 
481 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  59.44 
 
 
469 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  59.23 
 
 
481 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  59.23 
 
 
481 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  59.23 
 
 
468 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  58.28 
 
 
468 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  59.44 
 
 
611 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  59.01 
 
 
469 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  56.53 
 
 
461 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  57.92 
 
 
514 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  57.17 
 
 
461 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  56.96 
 
 
461 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  58.55 
 
 
455 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  56.96 
 
 
461 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  52.7 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  49.46 
 
 
440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  49.09 
 
 
439 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  48.05 
 
 
433 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  46.02 
 
 
443 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  45.99 
 
 
444 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  47.53 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  47.08 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  44.4 
 
 
444 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  44.47 
 
 
444 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  46.07 
 
 
454 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  44.23 
 
 
444 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  43.97 
 
 
444 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  46.19 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  45.53 
 
 
444 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  44.01 
 
 
444 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  45.53 
 
 
444 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  44.18 
 
 
439 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  44.64 
 
 
439 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  43.87 
 
 
454 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  45.32 
 
 
444 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  43.53 
 
 
444 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  42.89 
 
 
437 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  41.83 
 
 
441 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  42.17 
 
 
436 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  42.67 
 
 
437 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  42.67 
 
 
437 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  41.61 
 
 
441 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  41.61 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  41.61 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  41.61 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  41.61 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  41.61 
 
 
441 aa  362  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  41.39 
 
 
441 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  42.17 
 
 
436 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  43.44 
 
 
442 aa  359  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  41.39 
 
 
441 aa  359  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  42.46 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  40.95 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  40.95 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  40.95 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  40.95 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  41.59 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  42.27 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  42.27 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  40.73 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  41.16 
 
 
437 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  41.16 
 
 
441 aa  350  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  42.95 
 
 
435 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  40.95 
 
 
441 aa  350  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  41.23 
 
 
439 aa  350  4e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  42.67 
 
 
449 aa  346  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  39.14 
 
 
443 aa  345  7e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  44.23 
 
 
442 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  39.52 
 
 
439 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  41.96 
 
 
443 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  43.53 
 
 
437 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  44.01 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  42.42 
 
 
452 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  39.22 
 
 
461 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  41.54 
 
 
445 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  39.19 
 
 
436 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  43.79 
 
 
446 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  41.09 
 
 
439 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  42.6 
 
 
414 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>