More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4765 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  72.97 
 
 
321 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 
299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 
299 aa  321  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.58 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.58 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.29 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.9 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  55.59 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.27 
 
 
297 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.44 
 
 
308 aa  314  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
300 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 
308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.04 
 
 
299 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.51 
 
 
301 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
297 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
307 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.82 
 
 
201 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
287 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
287 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
291 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
285 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
292 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
276 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 
271 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  31.03 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
291 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 
291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
286 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
268 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.17 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  30.77 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
284 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
344 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
273 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 
291 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 
291 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  28.05 
 
 
291 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
269 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
268 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
277 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
306 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 
291 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 
278 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 
281 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
268 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
272 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
268 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
266 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  27.76 
 
 
291 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
286 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
268 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
271 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  28.05 
 
 
291 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
272 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
342 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
291 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
279 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
270 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
265 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
272 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
279 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
281 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
282 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
272 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
280 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.33 
 
 
277 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.9 
 
 
270 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
283 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
268 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
314 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
268 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
258 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
278 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
282 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
282 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
272 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
287 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>