42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4763 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  89.87 
 
 		 158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  41.75 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 155 aa  84  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  38.74 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  38.74 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  39.45 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  34.42 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  30.63 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  36.84 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  31.07 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  31.07 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  33.98 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  40.51 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  35.79 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  34.04 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  32.46 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  37.63 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  36.26 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  35.96 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  28.95 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  32.81 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  29.17 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3714  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3640  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3574  response regulator receiver domain-containing protein  53.19 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  29.87 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  35.06 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  24.73 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  28.83 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>