More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4648 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  333  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  86.54 
 
 
188 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  79.75 
 
 
158 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  79.62 
 
 
158 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  75.78 
 
 
168 aa  259  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  75.78 
 
 
168 aa  259  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  72.5 
 
 
167 aa  245  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  69.68 
 
 
197 aa  235  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  71.9 
 
 
186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  51.37 
 
 
161 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.81 
 
 
159 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.4 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
157 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  147  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
156 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
156 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
181 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
161 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
159 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
159 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
158 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
159 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
156 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  42.04 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.04 
 
 
169 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
154 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
159 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
159 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.26 
 
 
163 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.72 
 
 
229 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
159 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.4 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.4 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.4 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.4 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  40.76 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.4 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
157 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
158 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
175 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 
171 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.38 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>