More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4579 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4579  patatin  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  56.79 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  54.74 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  55.4 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  53.21 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  54.29 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  55.32 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  55.32 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  52.69 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  45.29 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  49.06 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  43.54 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  37.89 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  36.17 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  36.23 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  42.63 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  36.9 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  42.7 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  36 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  38.42 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  38.42 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  38.42 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  32.75 
 
 		 357 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  36.11 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  33.33 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  37.29 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  29.44 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  30.64 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  35.67 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.34 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  30.09 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  33.15 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.49 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  33.71 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.08 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  30.85 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  36.36 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  27.88 
 
 		 378 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  31.22 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.39 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  28.41 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.81 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.7 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  27.6 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  32.81 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  26.15 
 
 		 728 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.03 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.33 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.8 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.15 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.27 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.88 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.81 
 
 		 741 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  31.68 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  33.91 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  30.35 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  29.65 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  33.91 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  35.15 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  30.39 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  24.15 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.37 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.87 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.86 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  28.97 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  29.6 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.77 
 
 		 727 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  24.02 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  33.85 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  23.77 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.37 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.37 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  24.02 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  24.02 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  24.02 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  33.85 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  23.62 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  23.62 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  32.31 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  28.1 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  25.08 
 
 		 728 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  23.62 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  28.88 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  26.34 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  28.78 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  27.6 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.1 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  30.88 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  29.33 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.1 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.1 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  26.81 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.81 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  28.88 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  26.81 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.64 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  28.82 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  21.67 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  30.98 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  30.81 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>