More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4578 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 149 aa  309  9e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  83.78 
 
 		 149 aa  261  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  75.69 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  61.07 
 
 		 170 aa  186  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  59.06 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  58.39 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  62.76 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  58.14 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  59.06 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  60 
 
 		 187 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  58.39 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  53.15 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  57.81 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  55.81 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  56.92 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  57.94 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  51.72 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  58.73 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  52.9 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  51.02 
 
 		 315 aa  157  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  51.05 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  51.91 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 327 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 328 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  57.36 
 
 		 162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  55.04 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  62.92 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  42.15 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.4 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 171 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  39.68 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  39.17 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  35.94 
 
 		 180 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  37.9 
 
 		 188 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  37.9 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 185 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  38.21 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  41.67 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.29 
 
 		 187 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  39.84 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  37.06 
 
 		 187 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 188 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  32.19 
 
 		 189 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 161 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  39.5 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>